Et si ? Et si tout simplement l'histoire avait été différente ? Après le sacrifice du Sandaime Hokage, Minato & Kushina ont pu survivre, faisant alors du Yondaime Hokage le nouveau Jinchûriki de Kyûbi. Après son attaque avortée, l'homme masqué à l'origine des troubles à Konoha, a décidé de remettre le couvert, et met déjà en place, son prochain plan machiavélique. Prenez part à un nouveau système de jeu. Vous vous retrouverez mêlés à des intrigues diverses et variées, avec la possibilité d'incarner vos personnages préférés, ou un personnage de votre création.